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一篇題為“使用蛋白質(zhì)組學(xué)和小RNA數(shù)據(jù)進(jìn)行人類血漿年齡預(yù)測(cè)：比較分析”的新研究論文已發(fā)表在《Aging》雜志上。
基于綜合分子數(shù)據(jù)構(gòu)建的衰老時(shí)鐘已成為醫(yī)學(xué)、法醫(yī)學(xué)和生態(tài)研究領(lǐng)域有前景的工具。然而，很少有研究比較不同分子數(shù)據(jù)類型預(yù)測(cè)同一隊(duì)列中年齡的適用性，以及將它們結(jié)合起來(lái)是否會(huì)改善預(yù)測(cè)。在這項(xiàng)新研究中，加文新南威爾士大學(xué)卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員 Jér?me Salignon、Omid R. Faridani、Tasso Miliotis、Georges E. Janssens、Ping Chen、Bader Zarrouki、Rickard Sandberg、Pia Davidsson 和 Christian G. Riedel醫(yī)學(xué)研究所和阿斯利康在 103 份人類血漿樣本中的蛋白質(zhì)和小 RNA 水平上對(duì)此進(jìn)行了探索。
研究小組寫(xiě)道：“在這里，我們擴(kuò)大了根據(jù)同一隊(duì)列的不同類型分子數(shù)據(jù)構(gòu)建的衰老時(shí)鐘之間有限的比較組合?！?/p>
首先，研究人員使用兩步質(zhì)譜法測(cè)量 612 種蛋白質(zhì)，選擇并量化豐度隨年齡變化的 21 種蛋白質(zhì)。值得注意的是，隨著年齡的增長(zhǎng)，補(bǔ)體系統(tǒng)成分的蛋白質(zhì)含量也隨之增加。接下來(lái)，他們使用小 RNA 測(cè)序來(lái)選擇和量化一組 315 個(gè)小 RNA，這些小 RNA 的豐度隨著年齡的增長(zhǎng)而變化。其中大部分是微小RNA (miRNA)，隨著年齡的增長(zhǎng)而下調(diào)，并預(yù)測(cè)其目標(biāo)基因與生長(zhǎng)、癌癥和衰老相關(guān)。最后，該團(tuán)隊(duì)利用收集到的數(shù)據(jù)建立了年齡預(yù)測(cè)模型。
在不同類型的分子中，蛋白質(zhì)產(chǎn)生的模型最準(zhǔn)確(R2 = 0.59 ± 0.02)，其次是 miRNA，是表現(xiàn)最好的小 RNA 類別(R2 = 0.54 ± 0.02)。有趣的是，蛋白質(zhì)和 miRNA 數(shù)據(jù)的結(jié)合使用改善了預(yù)測(cè) (R2 = 0.70 ± 0.01)。未來(lái)的工作將需要使用更大的樣本量和驗(yàn)證數(shù)據(jù)集來(lái)確認(rèn)這些結(jié)果。
研究人員總結(jié)道：“盡管如此，我們的研究表明，結(jié)合蛋白質(zhì)組和 miRNA 數(shù)據(jù)可以產(chǎn)生更好的年齡預(yù)測(cè)，這可能是通過(guò)捕獲更廣泛的與年齡相關(guān)的生理變化來(lái)實(shí)現(xiàn)的。確定結(jié)合不同分子數(shù)據(jù)類型是否可以作為一種通用的方法將很有趣?！备纳莆磥?lái)老化時(shí)鐘的策略?！?/p>
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